Tarmslimhinden er organets inderste lag, og den vender således direkte mod tarmens lumen i tæt kontakt med fordøjelsesprodukterne.
Under slimhinden, der fortsætter udad, mødes de resterende tunikaer: submucosa, muscularis og serosa.
Tarmslimhinden består til gengæld af tre forskellige dele: et enkelt lag af epitelceller, et bindevæv, der holder epitelet (lamina propria) på plads og et lille lag af glat muskel, kaldet muscularis mucosae, der adskiller den fra tunikaen herunder.
I tyndtarmen har tarmslimhinden et fløjlsagtigt udseende, givet af den udbredte tilstedeværelse af små fingerlignende kamme kaldet intestinal villi.
Ligesom planter absorberer næringsstoffer i jorden gennem deres rødder, absorberer intestinal villi stoffer, der er afgørende for cellevækst og overlevelse.
Tarmvilli (se figur) har til formål at øge den absorberende overflade, yderligere forlænget ved løft af slimhinden i makroskopiske folder og ved synkningen af epitelaget:
de talrige folder i tarmslimhinden i tolvfingertarmen og jejunum kaldes folder, halvmånefold eller bindeventiler, mens epithelens rørformede invaginationer, som bærer dybt ind i det bindevæv, kaldes krypter.
Det anslås, at tarmslimhinden er dækket af omkring 40 millioner villi, cirka 18-40 pr. Hver villus består af en forbindelsesakse dækket af et enkelt lag af absorberende celler, hvis membran - vendt mod lumen - har tynde cytoplasmatiske fremspring som en handskefinger.Disse bittesmå relieffer, der kun er synlige under elektronmikroskopet, kaldes microvilli og udgør tilsammen penselgrænsen.
Den særlige konformation af de absorberende celler, også kendt som enterocytter, har til formål at maksimere fordøjelsen og absorptionskapaciteten af organismen.
Blandt de numerisk mest talrige enterocytter skiller nogle bægerceller sig ud, der udskiller slim ind i tarmlumen. Dette tyktflydende og smørende stof er ansvarligt for at beskytte tarmslimhinden mod fornærmelser af syrer og fordøjelsesprodukter samt mod fordøjelsesenzymer, der kan angribe det.
I furer arrangeret mellem villi finder vi en yderligere komponent, repræsenteret af Galeazzis kirtler eller Lieberkuhns krypter, spredt gennem tyndtarmen og også til stede i tyktarmen. Krypter består af celler, der modnes til enterocytter (absorberende celler), af andre, der behandler slim, af serøse celler, der syntetiserer enzymatiske proteiner, af Paneth-celler, der producerer lysozym og andre antimikrobielle enzymer og af sølv-affine celler i gastro -endokrine system. tarm, som producerer endokrine og parakrinhormoner for at lette fordøjelsen og absorptionen.
Tarmslimhinde "