Det er vigtigt at skelne mellem akut og kronisk diarré, lokalisere problemet i tynd- eller tyktarmen og forstå, om diarré skyldes en primær gastrointestinal sygdom, eller om den er en konsekvens af en ekstraintestinal sygdom.
I betragtning af de forskellige årsager til diarré og dens potentielt selvbegrænsende karakter bør den diagnostiske tilgang variere alt efter patientens kliniske historie, symptomernes sværhedsgrad og tilgængeligheden af ejeren.
er de mest almindelige årsager. I disse tilfælde er sygehistorien meget vigtig (kontakt med syge dyr, kendte intolerancer, ophold i kenneler, forbrug af understegt eller forkælet mad).Tilstedeværelsen af slim, levende blod, vanskeligheder og hastende ved afføring er tegn på et problem med tyktarmen, mens vægttab og tilstedeværelsen af fordøjet blod indikerer involvering af tyndtarmen.
For dyr med mild diarré, normalt mad- og vandforbrug, ingen opkastning eller dehydrering, er understøttende pleje ofte tilstrækkeligt. I tilfælde af progression af kliniske tegn, med dehydrering og tab af appetit, er det nødvendigt med yderligere diagnostiske tests, såsom afføringstest, test for infektionssygdomme og blodprøver, med særlig opmærksomhed på dyr med tegn på systemiske sygdomme.
Diarré hos ledsagende dyr har været relateret til Clostridium perfringens, Clostridium difficile, Campylobacter, Salmonella og E. coli. På den anden side rummer mange sunde dyr imidlertid disse bakterier, og deres fund indebærer ikke nødvendigvis tilstedeværelsen af kliniske tegn.
Især er der en tilsyneladende sammenhæng mellem C. perfringens og akut hæmoragisk diarré, men det er ikke klart, om tilstedeværelsen af denne bakterie er årsagen eller konsekvensen på grund af en "ændring i tarmmikrofloraen; det samme gælder for C. svært.
Campylobacter er derimod i stand til at forårsage gastrointestinale symptomer især hos unge dyr, der udsættes for disponerende faktorer som stress, overfyldning og ledsagende sygdomme.
Nogle typer af E coli kan forårsage tarminfektioner hos hunde med nedsat immunforsvar og er ofte involveret i Boxer granulomatøs colitis, med lignende læsioner også beskrevet i den franske Bulldog og Border collie.