og måderne, hvorpå infektionen spredes, kan være forskellige. Koloniseringen medieret af patogener kan faktisk finde sted gennem:
- Stigende vej fra blæren (den hyppigste): fra perineum (eller fra vaginal vestibule, for kvindelige patienter), går mikroorganismerne op i urinrøret, derefter i blæren, op til nyrerne; hovedårsagerne infektion for kvinder består i deformation af urinrøret under samleje, mens det for mænd ofte er sekundært til prostatitis. Hos kateteriserede patienter kan der opstå kontaminering efter placeringen eller manipulationen af kateteret, med deraf følgende mulig stigning af patogener i blæren .
- Blodfaldende rute: gennem blodbanen, i løbet af septikæmi, når patogenerne til nyrerne og forårsager nefritis og nyre -bylder.
- Nedadgående lymfatisk vej: et netværk af lymfekar forbinder den stigende tyktarm med den højre nyre og den nedadgående tyktarm med den venstre nyre.
De mikroorganismer, der er involveret i pyelonephritis, er normalt de samme ansvarlige for infektioner i urinvejene, i kønsorganerne og mave -tarmkanalen, derfor i blæren, prostata, livmoderhalsen, vagina, urinrøret eller endetarmen: Escherichia coli, Klebsiella spp., Proteus spp., Enterococcus spp. etc.
I de fleste tilfælde repræsenterer disse patogener bakterierne i fækalfloraen, som går den stigende vej, selvom peristaltik generelt (bevægelser af sammentrækninger og udspænding af urinvejets vægge) udfører en "effektiv beskyttende handling mod infektioner.
Andre usædvanlige mikroorganismer rapporteres lejlighedsvis: mykobakterier, gær og svampe samt opportunistiske patogener som f.eks. Corynebacterium urealyticum.